Американские биологи нашли следы действия естественного отбора на ВИЧ. Согласно их выводам, успешнее всего размножаются вирусы, которые накапливаются в крови в большем количестве, а значит и более заразны. Эту тенденцию специалисты отслеживали последние 10 лет. Судя по всему, она не зависит от стратегии борьбы с ВИЧ. Результаты исследования опубликованы в журнале Nature Communications.
Классическая теория эволюции предполагает, что естественный отбор действует на все организмы, способные размножаться. Таким образом есть вероятность воздействия его и на вирусы, с возможностью более и менее успешного размножения. Но следы такого воздействия найти проблематично.
Поскольку людей, зараженных ВИЧ много, и они регулярно сдают анализы, то синдром иммунодефицита для таких исследований – очень удобная модель. Сотрудник Калифорнийского университета Джоель Вартхайм в сотрудничестве с другими учеными изучил результаты анализов крови 41409 пациентов, которым устанавливали диагноз.
У этих людей фиксировали количество вирусных частиц в крови до того, как их начали лечить. Это генетически детерминированный признак у ВИЧ. Он оказывает влияние на заразность вируса. Чем больше частиц, тем вероятнее их попадание в организм другого человека.
Чтобы оценить успешность распространения вирусов, исследователи сравнивали у них последовательность гена обратной транскриптазы и выделяли генетические кластеры — группы пациентов, которые заражены одним и тем же или крайне похожими вирусами. Чем больше размер кластера, тем активнее конкретный вирус.
Специалисты установили, что люди, входящие в состав генетических кластеров, концентрация вируса в крови точно выше (p < 0,001), чем у не входящих. Зависимость сильнее, если диагноз был поставлен на ранней стадии болезни.
Вирусная нагрузка на всех стадиях выросла (p < 0,001) с 2007 по 2016 годы. Так в 2007 году на ранних стадиях болезни находили в основном 13020 частиц на миллилитр крови, в 2016 —22100.
Ученые обратили внимание, что количество вирусных частиц в крови связано с тем насколько вирус включен в генетический кластер. Каждая дополнительная генетическая связь повышала вирусную нагрузку (p < 0,001).
Так были обнаружены действия естественного отбора на ВИЧ. Более заразные вирусы, которые накапливаются в большем количестве в крови, встречаются у более крупных групп пациентов — то есть лучше распространяются в популяции. При этом с течением времени ВИЧ эволюционирует в сторону большей заразности.
Как сообщалось ранее, Ученые обнаружили новый штамм ВИЧ
